天珠是天然的。较为古早的天珠都是在自然中产生的，所有海螺化石经过与海水的打磨形成的，但后来由于化石的稀缺，人们开始采用一种含玉质以及玛瑙成分的沉积岩打磨天珠。而市面上出售的天珠绝大多数都是采用含铅的涂料制作而成的。
天然天珠是指使用纯天然材料仅经过打磨而成的天珠，一种是由海螺化石打磨而成的天珠，叫“法螺天珠”，这是最一开始的天珠；另一种是由含玉质及玛瑙成分的九眼石页岩打磨而成的天珠，叫“九眼石页岩天珠”，也叫“天眼天珠”。
天然天珠的制作过程也分为两种，一种是古代工艺的古董天珠，这种工艺技术的产生源自于海螺化石的出现，西藏古人还是魔方沉积岩上的图案，在玛瑙上人工绘制天珠，但这种方法现在已经失传，市面上流通较少，极为珍贵。
另一种是由现代工艺制作的饰品天珠，利用现代化工艺技术对玛瑙等石料进行加工仿制古法天珠而做出来的工艺品，数量较多，价值较低。
最一开始的海螺天珠存量稀少，由于其独特造型特性，并承载了藏民的信仰，被称为“珠中之王”。
