pcr预变性的温度和时间是根据所采用的pcr试剂盒说明来确定的,不同的试剂盒,预变性的温度和时间会有稍微的差别,比如有的试剂盒要求的预变性是94℃,5分钟,有的试剂盒要求的预变性是95℃,4分钟等,类似的微小差别。
计算退火温度的方法:
1.退火温度=4×(G+C)+2×(A+T)-(5~8)只是粗算,有时不灵,但比较简便。
2.用primer5(oroligo6)计算,引物配对好后,primer5可以显示Tm,我认为这个值就是退火温度,我的经验再加2or3度最好。
3.合成引物的单子上也有个Tm,减去5~8也可,但有些公司提供的Tm就是方法1计算的。