扎陵湖和鄂陵湖颜色不一样的原因主要有以下几点：
1、黄河流入扎陵湖时带来了大量的泥沙，使得扎陵湖的水质浑浊，呈现出乳黄色。而黄河流出扎陵湖后，在巴颜朗玛山形成峡谷，河水分成九股道，散乱地穿过峡谷，在西南隅流入鄂陵湖。这个过程中，黄河的泥沙被过滤掉了很多，所以鄂陵湖的水质比较清澈。
2、扎陵湖和鄂陵湖的水深也不同，扎陵湖平均水深8.9米，而鄂陵湖平均水深17.6米。水深的不同也会影响水体对光线的反射和折射，从而影响水色的呈现。
3、扎陵湖和鄂陵湖的生态特征也有差异，扎陵湖中浮游藻类较多，而鄂陵湖中浮游藻类较少，浮游藻类的种类和数量也会影响水体的颜色。
