1.收获：秋后正值菊芋块茎快速生长的时期，待到10月上旬，菊芋的叶、茎完全被霜冻死，即可收获地下块茎了。采用人工或机械等办法，把菊芋块茎从土里取出即可。
2.冬季贮藏：如果是第二年春季用菊芋的话，可以在秋后把菊芋杆割去，不收菊芋块茎，但第二年春季要尽可能早些取出，否则发芽很快（地温2℃即开始萌发），影响菊芋质量。冬季贮藏方法：秋季挖一浅窖，把菊芋放入，随即撒上沙土，保持湿度和足够的通气，然后四周盖上5厘m厚的土，不要让菊芋暴露出来。大量贮藏时，可用草把子作几个通气孔。菊芋在0℃以下即开始冬眠，冬季贮藏期间怕热不怕冷，只要有土盖住，-50℃也不会被冻死，第二年仍可发芽生长。要本着这一原则做好冬季贮藏工作，只要温度不高，就不会霉烂。
3.包装与运输：菊芋的包装一般可采用塑料编织袋包装，即透气又保湿，一般放置10-20天没问题。
4.菊芋的运输可采用汽运或铁路运输，采用汽车运输应将菊芋用苫布盖好，以免失水过多。铁路运输最好选用通风的车皮装载。若选择船运，应将菊芋置于通风良好、低温的状态下海运时间最好不超过30天。
