1、资金来源不同：民办学校和公办学校都是经过相关部门批准才成立的学校，两者间最大的区别应该就是资金来源不同。公办学校是国家拨款，大部分办学经费都是来自政府；而民办学校则是要靠自筹，办学经费主要是来自企业。
2、招生方式的不同：公办学校招生是由各当地教委抽取建档线以上，直接进入高等院校学习深造；而民办院校则是在高考生进入高考期后，由本校派人直接到各地招收学员。
3、办学主体的不同：民办学校是由民间资本为主体办学，其法人代表为最大股份持有者；公办学校由国家出资办学，其法人为代表国家机关来管理学校资产者。 4、管理模式不同：公办中小学和幼儿园由区/县教育局领导下的校长负责制，主要领导权力在当地教育局手中；而民办学校是由董事会领导下的校长负责制，实际领导权力在大股东的手中。
5、行政体制不同：公办学校由于是国家单位的下属机构，所以其在编工作人员均拥有国家的事业单位编制，并享受国家干部待遇；民办学校由于是民间机构办学，因此没有编制，像一般企业一样自负赢亏、享受一般企业职工的待遇
