出纳账本的记账方法有两种，分别是单式记账法和复式记账法。
其一，单式记账法将所有的经济业务仅仅按照金额来简单地记载在一个账本上，其中的内容较为简单明了，但缺少原始凭证的辅助，难以进行科目分类和核算。
其二，复式记账法则是将经济业务按照借贷两方面的交易内容分别记录在两个相对应的科目账户上，从而更加具有科学性和可操作性，适用于大型企业的核算需求，它需要出纳员根据每项经济交易的发生，确定相应的借方、贷方科目，然后按照统一的记账规则和方法进行凭证和账务的处理。
无论选择何种记账方法，出纳员应当注意每笔交易的真实性、准确性和完整性，同时建立较为完善的财务档案体系，便于随时查阅和对账。
