绿松石所独有的颜色是由于其体内所含的致色离子而呈现出来的，当绿松石内所含的铜离子越多，则趋向于蓝色；当绿松石内所含的铁离子越多，则趋向于绿色。
所以，绿松石按颜色可以分为三大类：蓝色系，绿色系、灰（白）色系。其价值，则是天蓝色的绿松石最好，其次为深蓝色、蓝绿色和浅灰蓝色，颜色越均衡越好。
许多优质的绿松石亦经过表面的某些优化来稳定绿松石的颜色，有些稳定是必要的，且获得国际范围的行业认可。
更多见的则是通过染色、再造（将太浅和太软的绿松石磨成粉末，加入树脂，重新做出绿松石来，可见褐铁矿脉线）等处理方式来人为改变绿松石的性状，这些绿松石价值就很低了。
