互助土族自治县境南端是海拔2100多米的湟水河谷盆地，向北是海拔2400—3500米的丘陵、中高山，中北部是海拔4242—4374米高矗的龙王山、仙米达坂山和东砚山，高差达2274米。
互助土族自治县地形地貌分为：北中部高山区，其海拔为3300米，面积为2178.3平方公里，占全县总面积的63%；脑山滩地区，属海拔为3000米左右的中高山及山间盆地，面积为250平方公里，占全县总面积的7.3%；浅山丘陵区（中山及高丘陵），其海拔多在2200—2700米左右，面积约785平方公里，占全县总面积的22.7%；川水河谷地，属县境南部川地，面积约243.7平方公里，占全县总面积的7%。
