作物生长发育过程中除了需要氮、磷、钾、钙、镁、硫等营养元素外，还有一些元素需要量很少，在植物体内的含量范围一般只有百万分之几至十万分之几，最高含量一般不超过0.1%，而且在土壤中这些元素的含量也很低，这类营养元素总称为微量元素，含有这些微量元素的化合物，并用作肥料的就是微量元素肥料。菜地常用的微量元素肥料有锌肥、硼肥、锰肥、铜肥、铁肥和钼肥等几种。
（1）锌肥。
我国西北和华北地区土壤大范围缺锌，另外在江苏北部、湖北、安徽等地的石灰性土壤中锌的含量也较低。土壤中有效锌的丰缺指标列于表11，其中DTPA提取值适用于石灰性土壤，0.1摩尔/升盐酸提取适用于酸性和中性土壤。
北方地区土壤有效锌含量小于1.0毫克/千克，南方地区土壤小于1.5毫克/千克就需要施用锌肥。土壤有效锌含量大于此值的地方应参照植株含锌量进行诊断。一般而言，作物叶片中锌含量低于20毫克/千克时就需要施锌。
表11 土壤有效锌含量丰缺指标
常用的锌肥有硫酸锌、氧化锌和氯化锌等几种。硫酸锌是最常用的含锌微肥，工业品硫酸锌有七水硫酸锌（ZnSO4·7H2O）含锌22%，和一水硫酸锌（ZnSO4·H2O），含锌35%两种，白色或浅红色结晶，易溶于水。氯化锌（ZnCl2），含锌40%～48%，白色结晶，易溶于水。这两种锌肥均是水溶性的，宜作追肥和叶面喷肥或作拌种施用，也可作基肥。叶面喷肥浓度为0.2%～0.3%，拌种每千克种子用1～3克锌肥，须先和钙镁磷肥等混匀后再拌种。氧化锌（ZnO）含锌60%～80%，白色粉末，不溶于水，宜作基肥施用，每亩1.0～2.5千克。
（2）锰肥。
质地偏沙，pH较高（＞6.5），含碳酸钙较多的土壤容易缺锰，土壤排水不良时更易引起锰的缺乏。土壤有效锰的丰缺指标见表12。
表12 土壤有效锰丰缺指标
与大田作物相比，多种蔬菜对锰的需要量较高，土壤供锰不足时容易引起缺锰而减产。蔬菜中需锰较多的有洋葱、莴苣、豌豆、大豆、马铃薯、菠菜、芜菁等；需锰中等的有萝卜、胡萝卜、番茄、芹菜、甜菜等；菜花、甘蓝则需锰较少。一般作物叶片内含锰量小于20毫克/千克时即需要施锰肥，番茄等蔬菜作物叶片缺锰临界值在40毫克/千克左右。
常用锰肥有硫酸锰、氯化锰等。硫酸锰的化学分子式是MnSO4·H2O，含锰26%～28%；氯化锰的化学分子式是MnCl2·4H2O，含锰27%，两者都是粉红色结晶，易溶于水，水溶液也呈粉红色。硫酸锰和氯化锰均可作基肥，追肥或叶面喷肥施用。水溶性锰在中性和微碱性土壤中容易转化成难溶性锰，肥效降低，所以，用作叶面喷肥的效果明显高于土施。喷施用硫酸锰浓度一般为1000毫克/升左右，作基肥时亩用量约1～4千克，基肥可用缓效性锰肥如含锰玻璃肥料（锰含量10%～25%）、氧化锰（含锰41%～68%）、二氧化锰（含锰63%）等，用量可视其锰含量增减。
（3）硼肥。
我国南方地区酸性土壤缺硼面积较大，在北方地区的黄绵土、黄潮土和白浆土上也有缺硼土壤分布。用沸水提取的土壤有效硼丰缺指标见表13。
