在美国的一个高度机密的军事实验室中，故事主要讲述，在一个顶级机密的军事实验室里，一群智力超群的年轻科学家偶然间揭开了人体隐形的秘密。
他们以动物作实验获得了成功之后，Caine平日里骄傲自大，一意孤行。这次不顾生命安危和同事的劝阻，执意要拿自己的身体做试验品。小组成员成功地将塞巴斯蒂安变成透明人，但却不能再将他恢复原形。于是大家决定一定要找到揭开这个难题的解药“。然而，塞巴斯蒂安已经渐渐对自己隐形所带来的前所未有的能力而陶醉不已，他可以为所欲为而不被别人发现。他开始觉他的同事们正在做的挽救他的工作是对他的威胁，他已经失去了人性的理智……当同事们成功将他变成隐形人后，却发现不能将他还原。正当同事们为找到还原方法没日没夜工作时，Sebastian的身体和思想却发生了他们意想不到的变化。他越来越觉得隐形人好处多多，不愿意再回到从前的自我。他开始觉得同事们是破坏他隐形状态的最大威胁。透明人几乎可以说是把人类长期以来的梦想付诸于实现的电影，但是当人类拥有隐形的异能时，潜伏在人性底层的邪恶因子也开始作祟，舞弄权力的坏念头使人掉入欲望的深渊而无法自拔，这也是《透明人》在惊悚片的特技包装下，想探讨的深层人性主题。而曾经主演过《惊涛骇浪》《家有跳狗》的男星凯文贝肯，则在《第六感追缉令》大导演保罗范赫文的包装下，成了藉着隐形而一步步实现许多野心的疯狂科学家。导演保罗范赫文坦承，电影最困难的部份其实就是如何将透明人变得更真实，比较起来，这部电影的特效其实就有些类似之前他执导的《星舰战将》，就是在后斯制作过程中利用电脑动画加上原本没有的画面，而《透明人》也是如此，但是在大银幕前除了要呈现男主角皮肤和肌肉逐渐消失的真实感外，还得让观众能感受到一个看不到的物体带来的恐惧感。保罗范赫文同时指出，主角的权利欲望其实是他最让人害怕的地方，不过凯文的娃娃脸，是他当初挑他当男主角的原因，因为他的长像非常的符合导演保罗的胃口，也适合演此片主角。
