深惠城轨线路和站点大致明确，走向是西丽－坂田－平湖－龙岗中心－坪山－惠阳新圩－仲恺－惠环－麦地－惠州站。
深惠城轨与深珠城轨
在西丽站交汇
《规划》透露深圳将形成深圳北、西丽、深圳站及深圳东、福田、深圳机场、深圳坪山站“三主四辅”客运站布局。
其中，与途经惠州的赣深高铁、广汕高铁、厦深高铁有交集的主要有深圳北、西丽站、深圳坪山站等3个站。
深圳北站：广深港高铁主要客运站。主要办理广深港高铁动车始发终到、部分赣深、厦深高铁动车始发终到作业，以及厦深高铁－广深港高铁动车通过作业。
西丽站：赣深、深茂高铁主要客运站。主要办理赣深、深茂及部分厦深高铁动车始发终到作业，以及沿海高铁动车通过作业，兼顾办理部分深惠、深珠城际动车作业。
深圳坪山站：东部地区客运站。主要办理部分厦深高铁、深茂铁路动车始发终到作业，以及深茂~厦深高铁动车通过作业。
由此可见，深惠城轨将在西丽站与深珠城轨交汇，届时，市民搭乘深惠城轨到西丽站后，可以转乘深珠城轨到达珠海、澳门。
另一方面，市民搭乘赣深高铁、厦深高铁到西丽站、坪山站，还能转乘深茂高铁到达中 山、江门、阳江、茂名等粤西城市。深茂高铁江门至茂名段已于2018年7月建成运营，但深圳至江门段尚未动工，这一段起于西丽站，经东莞虎门、广州 南沙、中山、止于江门站。
这此轨道项目将进一步促进惠州与湾区兄弟城市人流、物流等的互联互通，显然也是《粤港澳大湾区发展规划纲要》“提升湾区内部联通水平，推动形成布局合理、功能完善、衔接顺畅、运作高效的基础设施网络”要求的一项落地措施。
走向：深惠城轨惠州拟设
新圩、仲恺、麦地等五站
自从今年3月，深圳铁路投资建设集团有限公司披露正在开展深惠城际（含东莞凤岗段）深圳段项目的方案研究以来，在市民眼里，这条一度被按下“暂停键”的深惠城轨迎来建设的曙光，该条消息被视为深惠城轨提上了日程。
此后，市发展和改革局在回复希望深惠城轨建设的相关网友提问时也透露，深惠城际铁路项目初步列为2022年前动工项目；正在进行规划的研究论证等前期工作，惠州市将与深圳一道共同推动深惠城际早日开工建设。线路、站点尚未明确。
惠州市民对深惠城轨的走向非常关心，从市网络问政平台可见，不少网友市民就惠州站点布局提建议，有人提议在仲恺高站，有人提议在陈江设站，还有提议在新圩设站等。
不过，从枢纽总图方案可以看出，深惠城际线路和站点大致明确，走向是西丽-坂田-平湖-龙岗中心-坪地-惠阳新圩-仲恺-惠环镇-麦地路-惠州站。如果这一走向确定，则意味着在人口较为密集的麦地片区，居民在家门口就能坐上城轨直达深圳。
