区别:位置不一样，虎门站位于中国广东省东莞市，是中国铁路广州局集团有限公司管辖的车站，是广深港高速铁路的中间站，也是东莞市西南部的交通枢纽。
虎门站它与众不同，火车站全长100多米，宽约40多米，底下3层分别为售票厅、候车室和设备区，总面积为1万多平方米。顶部为站台和6车道的火车轨道。它的火车站台离地面18米高左右,故拥有“空中火车站”之称。
虎门站为3层结构，一楼是售票厅、二楼是站厅层，三楼是站台层。其中一、二楼位于铁路桥下，三楼站台则位于铁路桥上，为高架雨棚。站房建筑面积1万余平方米，顶部为站台和6车道的火车轨道。站台雨棚建筑面积近3万平方米。
东莞南站
东莞南站是赣深高铁东莞段唯一站点，位于塘厦林村社区东红路附近，建设4台8线，站房面积28400平方米，规模在赣深铁路新建车站中排第二大。
东莞南站的站房面积达28400平方米，相当于4个标准足球场大小，也是赣深高铁全线14座车站中第二大站场。整个站场有三层，地下一层为架空层，可实现高铁同地铁、公交、小汽车等多种交通方式的换乘;一层为候车层，二层为站台层。
东莞南站候车大厅服务设施完备，座椅、按摩座椅、卫生间、茶水间、便利店一应俱全。
都是高铁站，祝你们旅途愉快。
