自考毕业后的档案放在人事考试中心存档。自考毕业档案即是自学考试毕业生登记表，指通过高等教育自学考试取得本科或者是专科文凭的毕业生所取得的学籍和毕业档案。里面包含着毕业生自学考试期间所取得的全部合格的自学考试本科或者是专科课程的成绩、实践论文成绩、毕业生个人的信息、省自考办和主考院校共同对毕业生的毕业审定结论和盖的印章等相关毕业生的档案信息内容。同时也是自学考试本科毕业生考研和考国家公务员和地方公务员重要人事档案及录取的重要调档的凭证。如果半年后，自学考试本科毕业生取得主考院校所颁发的学士学位证书，还会有主考院校发给盖有主考院校印章的学士学位审定表一份，和毕业生登记表合并一起，成为自学考试本科生的最后的毕业档案。
