1682年（永历三十六年）9月，降清的原明郑大将施琅上疏康熙帝请求征台，康熙答应并授全军权予施琅。翌年6月，施琅奉康熙诏，进攻澎湖。经过澎湖海战后，七月中旬，施琅顺利击溃刘国轩海军，攻占澎湖。
澎湖海战后，郑克塽于廷上征众臣议，朝臣分成死守台湾、迁吕宋岛再战与降清三派。再战派以中书舍人郑得潇、建威镇黄良骥、水师镇萧武、中提督中镇洪拱柱等人为中心，向郑克塽以及冯锡范力主征伐吕宋、永保明郑国祚；然而，原本听从再战派的冯锡范却听信刘国轩的主和言论，最终选择投降清朝，而年幼无权的郑克塽也跟他一起投降了。[20]
1683年（永历三十七年）九月；郑克塽采刘国轩建议，呈降表予清。[21]明郑降清不久，许多在台湾的明朝宗室例如朱术桂等纷纷自杀殉国，冯锡范将郑克塽送交施琅，并提出“三不伤”请求，即清军入岛“不伤郑室一人，不伤百官将士一人，不伤台湾黎庶一个”。八月十三，施琅进入台湾受降。自此，明郑灭亡。
这便是明郑的结局。
