支付宝背后的掌控人依然是马云。虽然马云掌控支付宝，但第一大股东却不是他，而是杭州君瀚。
支付宝第一大股东是杭州君瀚股权投资合伙企业，拥有支付宝28.45%的股份。排名第二的大股东是君澳股权投资合伙企业，拥有支付宝21.53%的股份。君瀚股权的第一大股东是杭州君洁。
杭州君洁的股份完全掌握在阿里巴巴高管手中，其中掌握杭州君洁0.47%的杭州云铂投资由马云百分百控股。
虽然马云占据的股份较少，但因为马云利用合伙人制度，以微量的股份牢牢掌控了杭州君洁，毕竟其他阿里巴巴高管虽然占据了大量股份。
但因为其有限合伙人的身份，对公司没有决策以及管理权，而马云却因其普通合伙人的身份，拥有以上权限。
