石河子大学属于一本重点大学，现有经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学11大学科门类。学校有94个本科专业，8个一级学科博士学位授权点、26个一级学科硕士学位授权点、20种硕士专业学位授权类别、4个博士后科研流动站、2个博士后科研工作站。现有国家一流建设学科1个、国家重点学科1个、自治区重点学科10个。临床医学、农业科学、化学3个学科进入ESI全球前1%。有国家级一流专业建设点12个、国家级一流课程8门，省级一流专业建设点18个。医学院属于石河子大学的一个系，所以石河子大学医学院属于一本。
