纳豆的常见吃法有两种：
1. 早饭配菜吃： 做法很简单，把纳豆装在小容器里，加入小勺酱油，适量的黄芥末，少许葱花，然后使劲地搅。直到基本没有单独分离的豆子，都黏乎乎地搅在一起，用筷子能够拉出长长的丝。然后盖在热气腾腾的白米饭上就着吃，能配上一些小盘咸菜和味增汤就算是最完美的搭配了。
2. 夹饭团吃： 做饭团子要用刚蒸好的米饭，趁热用木勺多翻几次，增强粘性。然后在稍稍不烫手的时候，在手心里捏出一个饼的形状，然后填入一勺不经搅拌的纳豆（一旦搅拌过，你会发现不光包不进去，而且到处都是纳豆丝），再盖上适量米饭后捏成三角形状，挨个摆好。 吃的时候用烤海苔片夹住吃，或者烤来吃，
纳豆本身并没有特殊的味道，既不臭也不香。不加佐料的话，吃起来有一点淡淡的黄酱味道（毕竟都是黄豆发酵产品）。唯一纳豆在中国不太能接受的原因就是，稍加搅拌纳豆就会出现一些粘液，形成拉丝，吃起来滑滑的口感会让一些国人不习惯。
