是有后续剧情的，余下的那只小哥斯拉在美国拍的哥斯拉动画版中出现，长成和电影版中的哥斯拉一样大的怪兽，不过本性是好的，帮助人类打变异怪兽。
延续电影的剧情，美日的两家公司共同制作了《哥斯拉：动画系列》，总共两季37集（其实不止37集，本人自己的VCD就有41集，还没有结局，结局至今无人知晓），亚洲区HBO曾在2000年播出过中文字幕版。在此系列中，尼克·塔特普洛斯意外发现了那颗没有被摧毁的蛋，刚好此时蛋孵化了，刚出生的哥斯拉因为对尼克不小心沾到哥斯拉蛋的羊水产生了铭印而亲近他，后来更和主角们一起帮人类对抗接踵而来的其他变种怪兽。动画版的哥斯拉和电影版的不太一样，因为要面对多种不一样的怪物，就要拥有强大的力量，制作公司刻意使动画版的哥斯拉近似日本的哥斯拉，所以让它也可以吐出强力的热线，而且体型比它母亲大一倍，拥有日版一般坚硬的皮肤，导弹之类的武器已经无法伤他分毫。动画的剧情走向很好，对人类内心的黑暗也进行了刻画。比起 索尼电影版《哥斯拉》更受原著迷的认同。
