一、适用平台上的差异。 到目前为止，微软的SQL Server数据据库只支持微软的操作系统。而DB2 数据库不仅支持Windows操作系统，而且还支持Linux等开源操作系统。也就是说，DB2具有很好的跨平台性能。现在很多企业中，都是以Linux或者Unix操作系统作为数据库服务器的。这主要是因为从安全性和稳定性上面Linux或者Unix操作系统都要比Windows操作系统略胜一筹。所以从这一点来说，DB2 数据库就要比SQLServer数据库的应用面要广。
二、安全性上的差异。 对于数据库来说，特别是那些相互联网用户开发的数据库系统，安全性一直是左右数据库选型的主要因素。而在这个安全性上面，SQLServer数据库与DB2数据库之间有很大的差异。据笔者所知，SQLServer数据库到目前为止，没有取得任何国际上认可的安全证书。而对于DB2数据库来说，其已经获得了国际上最高级别的ISO标准认证。，虽然说证书不能够说明问题，但是至少说明DB2 数据库的安全性也是有所保障的。微软在SQLServer数据库上安全投入的不足，让其无法适应互联网安全的威胁。为此这也让SQLServer数据库少了很多订单。
三、数据处理上的差异。 在数据处理的能力上，SQLServer数据库与DB2数据库也有很大的差异。SQLServer数据库虽然支持多用户，但是在大量并发访问的情况下，性能会显著下降。而DB2 数据库可以说是专门为处理大量的并发访问所涉及的。在数据处理上，如果并发行访问比较少或者数据量并不是很大，那么DB2数据库与SQLServer数据库相比，并不会有很大的优势。甚至可能还是SQLServer数据库的性能比较好。但是如果涉及到海量数据的处理，如数据仓库或者企业级的应用，那么DB2数据库的性能就要远远超过SQLServer数据库。从这一点上来说，DB2 数据库适合一些企业级的应用，而SQLServer数据库则因为价格相对便宜、维护相对简单，而比较适合中小企业使用。
四、在投资成本上的差异。 企业部署数据库应用时，所耗费的成本主要有三块，分别为硬件上的投资、数据库授权与人员的支出。在硬件上的投资，两个数据库没有多大的差异。但是在数据库的授权成本与人员的支出上，却有很大的差异。从数据库的授权成本上看，DB2 数据库要比SQLServer数据库高的多。从人员的支出看，企业招募一个DB2 数据库管理员要比招募一个SQLServer数据库管理员贵的多。这主要是因为DB2数据库管理员比较少，而且其往往需要同时维护多个分支机构的应用。所以DB2数据库管理员的价格就要比SQLServer的价格贵好几倍。所以说，从整体成本来看，企业部署DB2数据库要比采用SQLServer数据库贵许多。 可见DB2与SQLServer数据库各有优劣。企业需要根据自己的规模、对于安全性的考虑、性能上的要求以及可以接受的成本等多方面来进行权衡，才能够选择一个合适自己的数据库系统。
