主要区别是，性质不同、民族主义方面的不同、民权主义方面的不同、民生主义方面的不同，具体如下：
一、性质不同
1、新三民主义
新三民主义，是孙中山生前对其“三民主义”思想作出的最后一个版本的修正，是孙中山晚年联俄联共、扶助和依靠农工的思想体现。
2、旧三民主义
旧三民主义一般指三民主义，是孙中山所倡导的民主革命纲领，是其民主思想的精髓和高度概括。 三民主义的发展过程分为两个阶段，即旧三民主义和新三民主义。它为中国国民党信奉的基本纲领。
二、民族主义方面的不同
1、新三民主义
提出了反对帝国主义的目标。
2、旧三民主义
突出的是“反满”，矛头指向清王朝。
三、民权主义方面的不同
1、新三民主义
主张普遍平等的民权。
2、旧三民主义
只是抽象地提倡“自由、平等、博爱”。
四、民生主义方面的不同
1、新三民主义
提出了平均地权和节制资本的办法，承认“耕者有其田”，并谋求改善工人和农民的生活。
2、旧三民主义
只有“平均地权”的政纲。
