区别如下：
一、时间不同
上巳节 是中国古老的传统节日，又俗称为三月三、重三、三月节、三日节、小清明，也被叫做女儿节。该节日的时间经过变动，最初在汉代之前都被定为三月上旬的巳日，因此被称为“上巳节”，到了魏晋时期，此节日被固定为农历三月初三。
清明节 ，原为二十四节气，后成为节日，又叫做踏青节、行清节、祭祖节等，节期在仲春与暮春之交，通常是公历4月4日-6日，1935年曾将清明节固定为公历4月5日。现清明节以公历4月4日或4月5日为准。
二、起源不同
上巳节有起源于兰汤辟邪的巫术活动之说。
清明节源自上古时代的祖先信仰与春祭礼俗，兼具自然与人文两大内涵，既是自然节气点，也是传统节日。
三、内涵不同
上巳节是古代举行“祓除畔浴”活动中最重要的节日，人们结伴去水边沐浴，称为“祓禊”，此后又增加了祭祀宴饮、曲水流觞、郊外游春等内容。
清明节是中华民族古老的节日，既是一个扫墓祭祖的肃穆节日，也是人们亲近自然、踏青游玩、享受春天乐趣的欢乐节日。
