专业侧重点不同
工程物理学是文理院校设立的物理系专业，最为常见，主要偏重于物理的基础理论教育。
应用物理学是工科院校设立的物理系专业，偏重于物理的应用教育。
二、培养人才不同
应用物理学培养在物理学、邮电通信、航空航天、能源开发、计算机技术及应用、光电子技术、医疗保健、自动控制等相关高校技术领域从事科研、教学、技术开发与应用、管理等工作的高级专门人才。
工程物理学培养光学，量子物理，材料科学，应用物理学，纳米技术，微型品制造，力学工程，电工程，生物物理，控制理论，空气动力学，能量，固态物理人才。
