花骨鱼和棒花鱼二者的区别如下：
一、繁殖方式不一样。
花骨鱼产卵期为4~8月份，棒花鱼产卵期在5~6月，花骨鱼产卵数比棒花鱼多。
花骨鱼2~3龄达性成熟，产卵期在4~8月，期间水温16~23°C，怀卵量4.8~13万粒，分批产卵。卵粘性，受精卵黏附于植物的根须或水草上孵化，当水温20°C时，4天能孵出苗。初孵仔鱼在15天后开始摄食。
棒花鱼体长4.6厘米性成熟。繁殖期在5~6月份。雌鱼怀卵量1000~2000粒，由雄鱼保护。卵分3~4次产完，卵直径包括卵膜在内2~2.5毫米。受精卵散粘在沙粒上，产卵时水温约30℃。水温平均18℃时，6~8天能孵出仔鱼。
二、外形特征不一样。
花骨鱼下唇不发达，两侧叶狭窄；颚部中央有一小三角形突起，具须1对；体侧和背部青褐色，背侧在侧线鳞上方有一排10~12个黑斑点，背钟及尾鳍上也有许多不规则小黑点，背鳍起点显著隆起。腹部为白色，胸鳍、腹鳍、臀鳍灰白色。雄鱼在生殖期间体呈浅橘红色，头部和鳍上有追星。
棒花鱼唇厚，发达，其上不具显著乳突，上唇通常具有极不明显的褶皱，下唇中央1对卵圆形紧靠在一起的肉质突起为中叶，侧叶光滑，特别宽厚。雄性个体体色鲜艳，雌体色较深暗。雄体背部、体侧上半部棕黄色，腹部银白。头背部略呈乌黑，喉部紫红，头侧自吻端至眼前缘有1黑色条纹。
