有几种看法：第一，子婴是秦始皇的孙子，扶苏的儿子；第二，秦三世子婴是秦始皇的儿子，扶苏的弟弟；第三，子婴是秦始皇的弟弟；第四，子婴是秦始皇的弟弟或远亲。 还有另一句谚语说子婴是胡亥的哥哥。 根据史料记载，《史记·六国年表》说：“高立二世兄子婴”。
子婴在历史记载中分别出现了三个地方：《始皇本纪》、《李斯列传》和《蒙恬列传》。第二次统治后，威胁皇位的儿子被屠杀，甚至是秦始皇的女儿也未能幸免。 秦二世去世后，子婴被赵高作为继承人。子婴当然看到了赵高的诡计，所以回家和两个儿子商量。 扶苏去世约30岁，子婴若为扶苏之子，是不可能有两个儿子可以商量重大问题的。
关于秦三世子婴的身世，说法有很多。原因就是秦二世胡亥继位后，将他的兄弟姐妹全部杀死，唯独留下了子婴，通过这样的事迹来说，子婴就不可能是秦始皇的儿子或者孙子。假如是秦始皇的儿子或者孙子，秦二世应该将子婴杀死，因为秦始皇的儿子或者孙子对皇位会有危险，因此秦二世胡亥不会留下子婴。
