有区别。区别表现在：过程不同、本质不同、结构不同。
1、过程不同
层次分析法可以解决：首先需要一个制定一个目标，然后明确达到这种目标的评价指标，最后在确定我们可以做哪些工作来达到最终目标。
模糊综合评价可以解决：首先确定一个评价对象以及需要评价的各个方面，然后通过调查得出各个方面的调查数据，最后根据各个方面的权重来得出评价高低的百分比。
2、本质不同
层次分析法的特点是基于某个目标，对多个待评价方案进行评价，从而得到方案的重要性排序。具体到某个问题，其并无相应的数据。而模糊综合判别有相应的基础数据。
3、结构不同
模糊层次分析法将评价因素按照一定规则进行分类形成层次结构，一般有目标层、准则层和因素层三层结构，而模糊综合评价法直接是目标层、因素层。
