泗阳县辖11个镇、5个乡、3个街道、2个场。分别为：众兴镇、临河镇、新袁镇、王集镇、爱园镇、裴圩镇、李口镇、穿城镇、张家圩镇、高渡镇、卢集镇、庄圩乡、里仁乡、三庄乡、南刘集乡、八集乡；市农场、市棉花原种场；史集街道、城厢街道、来安街道
1996年，划归新设的地级宿迁市管辖。1999年底，全县辖7个镇、21个乡，4个场圃。共有607个行政村、13个居委会，4839个村民小组。
2000年2月，经省政府批准，同意撤销临河乡、城厢乡、李口乡，以其原辖区域设立临河镇、城厢镇、李口镇，实行镇管村体制。
2000年5月，根据江苏省相关文件精神，同意撤销众兴镇周庄、冷庄、前进、红光、俞杨、城西、五里、运南、东光、众东、东华；洋河镇东圩、大圩、西门、车站、庄西、新化、小街、三葛、平安；王集镇王集、振兴、直属、集东；新袁镇袁集、新集、新东、一号；城厢镇联合；临河镇肖庄、大兴、临河、临西；仓集镇仓集；裴圩镇单庄、裴圩；爱园镇农牧、爱园；李口镇李口、其虎、葛庄、安康、杨码等共43个村委会，设立43个相应的居委会。此外，泗阳棉花原种场增挂原种场第一、第二、第三居委会和小圩、庙东、五堆居委会牌子；泗阳农场增挂农场第一、第二、第三、第四居委会和建华居委会牌子。
2000年5月，泗阳县对行政区进行调整：经省政府批准，桃源乡、史集乡撤销并入众兴镇，葛集乡撤销并入来安乡，魏圩乡撤销并入王集镇，黄圩乡撤销并入裴圩镇，屠园乡前行、冯桥、解放、沙圩、西俞、二庄、周石七个村归洋河镇管辖，林柴场并入中扬镇，果树实验场并入爱园镇。
2000年7月，经省政府批准，同意撤销中场乡、穿城乡、高渡乡、郑楼乡、张家圩乡、卢集乡，以其原辖区域设立中扬镇、穿城镇、高渡镇、郑楼镇、张家圩镇、卢集镇，实行镇管村体制。2000年底，泗阳县辖15个镇、7个乡。
2004年3月，经宿迁市申请，省政府批复同意将泗阳县洋河镇、郑楼镇、中扬镇、仓集镇、屠园乡西南五大重镇给宿迁市宿城区管辖。2004年底，泗阳县辖12个镇、6个乡、2个场。
2005年8月，江苏省委、省政府决定调整泗阳县城区行政区划，撤销城厢镇、来安乡，将其划归众兴镇，全县设11个镇、5个乡、2个场、260个村（居）委会。
