区别很大。在一起通常指相爱的人,与其分开单过,不如携手共进,也是正式确立关系的说法。
再一起指原来的恋人或曾经在一起的人,不知何故分开了,有缘再会,再一起是重新确立关系的说法。再一起一定是曾经在一起过;不管咋样,这都是祝福语,决定权还在当事人。