1、培养方式不同。本硕更偏重基础理 论的学习，重点培养学生从事科学研究创新工作的能力和素质。专硕则以实际应用为导向，以职业需求为目标的。
2、报考条件不同。本硕在校生一般都可以报考的。专硕中有部分专业是必须需要工作经验的，比如：管理类专硕里面的MBA、MEM等、教育管理专硕等。
3、学制不同。专硕一般2~3年，其中不少于半年的实习期。本硕基本上以学习理论为主，学制一般为3~5年。
4、社会认可度不同。专硕为2009年教育部新增的硕士研究生，毕业生已颇具规模，认可度已经受社会考验，且有国家颁发的“双证”，前景不错。本硕由于是全日制正规大学硕士毕业，拥有学历、学位双证，因此社会对这样的毕业生的认可度非常高。
5、培养方向不同。专业型硕士是国家为了克服学术型硕士的不足新增的一种新硕士，培养的是市场紧缺的应用型人才。学术型硕士教育以培养教学和科研人才为主，授予学位的类型主要是学术型学位。
