1、金银版出自1998年，所以怪物不太齐全。
水晶出自2001年，画质，怪物，剧情都略胜金银版，但在记忆般基础上减少三个怪物，皮卡丘
多了，比金银版容易捉多了，如果你是个“卡丘迷”建议使用水晶版。
2、主人公有所变化。金银的主人公是男的，水晶的主人公有一男一女。
3、主神兽有所区别。金的主神兽是凤凰，银的主神兽是露基亚，水晶的主神兽(画面是超梦)是
雪拉比。
4、精灵的话,有些精灵只在金版出现，有些只在银版出现，但在水晶通通都出现了。
1、《口袋妖怪》系列是一套由日本GAME FREAK代表田尻智于1995年开发、日本任天堂株式会社于1996年推出的一款Game Boy（任天堂所推出之掌上型游戏机）游戏。
2、口袋妖怪系列游戏以角色扮演（RPG）为主，辅以战略和动作游戏，在游戏中，玩家总是作为一位PM训练家到各地旅行，完成各种交付的任务，并沿途与PM训练家挑战，不断提升自己的战斗能力，打败八大会馆的首领和四大天王，最终与冠军战斗，取得最后的胜利。游戏最大的乐趣是收集、捕捉各种各样可爱的精灵，完成口袋妖怪图鉴。
3、由于许多精灵在游戏中只有1只，而且一旦捕捉失败就没有第二次的机会，每部作品最后一只精灵要通过特殊的方法才能得到。因此，精灵的捕捉成为游戏一大乐趣。
