1、销售模式不同
京东自营店是B2B2C，就是商家先把货卖给京东，京东再卖给消费者，京东相当于商家的经销商，商家是供货商。店铺是商家和京东采销协同运营，但运营的主导权在京东。不管是上新、设置促销、标题商详优化、促销价格调整，VC后台几乎每一个操作都需要京东采销以及相关人员一层一层审核，采销可以直接驳回所有的操作。
pop店是B2C的模式，厂家直接把货卖给消费者，京东只是提供一个交易平台，相当于一个服务商。与自营店相比，pop店就没那么多讲究了。所有操作采销审核通过就完事，有些甚至不需要审核，可以说运营自主权完全在商家自己手上。
2、结算模式不同
京东自营的结算模式有很多种，最常见的有毛保，其他还有返点，实销实结等。毛保的的结算方式在笔记二里面有详细介绍过。pop店铺的结算方式就是扣点，类目不一样扣点不一样，一般在2%-6%之间。
3、获取到的流量资源不同
京东自营是京东商城的核心业务，在流量以及店铺排名方面有着天然的优势。在京东上搜索任意商品，京东自营店的商品排名比pop店的商品更靠前。入仓的自营商品会打上京东超市标和京东物流标，对商品也会有一定权重加成。对大部分消费者来说，京东自营的产品品质更有保障，发货物流时效都很快。相比pop店，消费者对京东自营的信任度更高。
4、发货模式不同
京东自营有两种发货模式。第一种是入仓，商家可以选择走TC转运入仓或者第三方物流直接入库。第二种是厂家直送。厂直的毛保会低于入仓的毛保，但厂直商品没有京东物流标，权重相对较低一点。对于一般商品还是建议入仓，像短保或者季节性产品可以选择厂直配送。
