恩科有万寿恩科、登极恩科之别。万寿恩科始于康熙五十二年，岁在癸已。五十一年，各省士子以圣寿六十，请开恩科。此后，乾隆、嘉庆、道光、咸丰、光绪朝，皆以皇帝万寿而开恩科。自乾隆朝起，皇太后万寿亦有恩科之例。
康熙五十二年（1713年）恩科 雍正元年（1723年）恩科 乾隆十七年（1752年）恩科 乾隆二十六年（1761年）恩科 乾隆三十六年（1771年）恩科
此外，尚有乾隆五十九年（1794）秋、六十年春，乾隆帝禅位嘉庆帝之乡会试恩科；光绪十五年（1889）秋、十六年春，光绪帝亲政之乡会试恩科。凡恩科之行，若逢正科之年，或移正科于前，或移正科于后，不拘成例。有清一代开科112次，其中正科84次，加科2次，恩科26次。恩科之多，实为清代科举的一大特点。
