北煤南运的主要通道是大同——秦皇岛,太原——青岛,侯马——石臼所,长治——连云港,长治——枝城,长治——武汉等铁路。
京沪、京九、京广、焦枝等铁路、沿海、长江和京杭运河水路运输线都是北煤南运的主要线路。