巴氏杀菌又称巴氏灭菌法，是一种利用较低的温度既可杀死病菌又能保持物品中营养物质风味不变的消毒法。
巴氏灭菌法的产生来源于巴斯德解决啤酒变酸的问题。巴斯德发现使啤酒变酸的罪魁祸首是乳酸杆菌，采取简单的煮沸的方法是可以杀死乳酸杆菌的，但是，这样一来啤酒也就被煮坏了。巴斯德尝试使用不同的温度来杀死乳酸杆菌，而又不会破坏啤酒本身。最后，巴斯德的研究结果是：以50℃~60℃的温度加热啤酒半小时，就可以杀死啤酒里的乳酸杆菌，而不必煮沸。这一方法挽救了法国的酿酒业。这种灭菌法也就被称为“巴氏灭菌法”。
巴氏杀菌主要应用在牛奶的生产上。通常，市场上出售的袋装牛奶就是采用巴氏灭菌法生产的。英国、澳大利亚、美国、加拿大等国家巴氏消毒奶的消耗量都占液态奶80%以上。在美国市场上，实际几乎全是巴氏消毒奶。
