主要区别如下：
1、评审方法不同，竞争性谈判采取最低价法，而竞争性磋商采取综合评分法。竞争性谈判的评审方法则是谈判小组所有成员集中与单个供应商分别进行谈判。并在规定的时间内进行二轮报价以及最终报价，然后采购人从谈判小组提出的成交候选人中选出最符合采购需求、质量和服务相对等且报价最低的供应商作为成交供应商，并将最终结果告知所有参加谈判的未成交的供应商；
2、评审侧重不同，竞争性磋商最主要考虑的则是综合指标。在磋商中，供应商可以更明确的理解采购需求，而在最终报价中，采取的也是综合打分的方式，这同样也是对供应商综合能力的一个判断；
3、供应商确定方式不同，竞争性谈判和竞争性磋商除了发布公告外，还可由采购人、评审专家分别作书面推荐，或者是从省级以上财政部门建立的供应商库中随机抽取；
4、文件发放日期不同，竞争性谈判的要求是从谈判文件发出之日起至供应商提交首次响应文件截止之日止，不得少于3个工作日；竞争性磋商的要求则是从竞争性磋商文件发出之日起至供应商提交首次响应文件截止之日止，不得少于10日；
5、澄清修改时限不同，竞争性谈判的规定是在递交首次响应文件截止之日3个工作日前，以书面形式通知所有接收谈判文件的供应商，如果不足3个工作日，则应当顺延供应商递交首次响应文件截止之日。竞争性磋商的规定则是在提交首次响应文件截止之日至少5日前，以书面形式通知所有获取磋商文件的供应商，若不足5日，则应当顺眼供应商递交首次响应文件的截止时间。
