第1集 云霄飞车杀人事件
第13集 奇妙的寻人杀人事件
第54集 电玩公司杀人事件
第128集 黑衣组织十亿元抢劫事件
第129集 来自黑暗组织的女子集大学教授杀人事件
第176集 与黑暗组织的再会（灰原篇）
第177集 与黑暗组织的再会（柯南篇）
第178集 与黑暗组织的再会（解决篇）
第230集 迷一样的乘客（前篇）
第231集 迷一样的乘客（后篇）
第271集 隐藏匆忙中的省略（前篇）
第272集 隐藏匆忙中的省略（后篇）
第286集 工藤新一纽约事件（事件篇）
第287集 工藤新一纽约事件（推理篇）
第288集 工藤新一纽约事件（解决篇）
第307集 没有声音的证词（前篇）
第308集 没有声音的证词（后篇）
第309集 与黑暗组织的接触（交涉篇）
第310集 与黑暗组织的接触（追迹篇）
第311集 与黑暗组织的接触（决死篇）
第338集 四台保时捷（前篇）
第339集 四台保时捷（后篇）
第340集 厕所隐藏的秘密（前篇）
第341集 厕所隐藏的秘密（后篇）
第345集 与黑暗组织的直面对决集满月之夜的二元推理
第425集 黑色的冲击!黑衣组织的魔爪伸来的瞬间
第462集 黑暗组织的影子集年幼的目击者
第463集 黑暗组织的影子集奇妙的照明
第464集 黑暗组织的影子集谜样的高额报酬
第465集 黑暗组织的影子集珍珠的流星
第491集 红与黑的碰撞集开端
第492集 红与黑的碰撞集血缘
第493集 红与黑的碰撞集疾呼
第494集 红与黑的碰撞集冥土
第495集 红与黑的碰撞集昏睡
第496集 红与黑的碰撞集侵入
第497集 红与黑的碰撞集觉醒
第498集 红与黑的碰撞集搅乱
第499集 红与黑的碰撞集伪装
第500集 红与黑的碰撞集遗言
第501集 红与黑的碰撞集嫌疑
第502集 红与黑的碰撞集洁白
第503集 红与黑的碰撞集决死
第504集 红与黑的碰撞集殉职
第509集 红白黄色与侦探团
第510集 柯南VS双重暗号之谜
第511集 推理对决!新一VS冲矢昴
第542集 鱼儿消失的一角岩（前篇）
第543集 鱼儿消失的一角岩（后篇）
第563集 侦探团VS劫匪团集骚动
第564集 侦探团VS劫匪团集沉默
第578集 召唤危机的红色前兆
第579集 黑色13的暗示
第580集 逼近的黑之时限
第581集 摇曳的红色目标
第622集 紧急事态252（前篇）
第623集 紧急事态252（后篇
