关于恶魔果实的起源，在海迷圈子里众说纷纭，有两种说法的可能性最大。
1.宝树亚当的果实
在七水之都，弗兰奇提到了一种叫做宝树亚当的树木，这种树木是海贼王世界最稀有的树，即便在黑市也是有价无市，只有运气好恰好遇到货源才能买到一部分木材，一小部分都能卖上2亿贝里的高价。
众所周知，亚当这个名字是圣经里记载的第一个人类，因受到蛇的诱惑吃了某颗果实而被逐出伊甸园。
在很多动漫里亚当的设定都是“万物起源”，而恶魔果实恰好跟亚当吃掉果实的事迹相吻合，再加上“恶魔果实1亿贝里、宝树亚当2亿贝里”的价格差距，说恶魔果实是宝树亚当的果实，并非不可能。
2.月球都市的科技
另一种猜测认为，恶魔果实是月球人科技制造出来的东西。月球人的存在相信大部分人已经了解了，艾尼路踏上月球后，我们发现空岛、加雅岛的居民都是月球移民，巴尔的摩的月见博士能制造月球上的机器人，也应该是月球的科学家。
贝加庞克就是巴尔的摩出生的人，现在他的科技能力超越世界500年，几乎可以肯定是因为他从月见博士那里获得了月球科技。
而贝加庞克制造出了第一颗人造恶魔果实，明明已经接近完美，贝加庞克却认为那是失败的果实，为什么呢？也许在贝加庞克设想中，他制造出来的恶魔果实应该跟普通的恶魔果实一模一样，因为普通的恶魔果实本来就有可能是月球人所“制造”出来的！所以一丁点的不同都让贝加庞克觉得自己失败了。
按照这个思路，我们去想一些细节：贝加庞克拥有月球科技、贝加庞克能用血统因子制造恶魔果实，那么很有可能这项科技在当年月球移民的手里，其实根本就是小儿科一样的技术。月球人也许制造了大量恶魔果实，并记载了每个果实的能力，结果在八百年前的那场巨变中，这一切历史都被天龙人抹消了。
为什么恶魔果实能力者怕海？按照“月球人制造”的理论完全可以解释这一点——因为月球没有液态水！科学证明，月球上只有气态水和固态水，液态水是不存在的，所以月球人制造恶魔果实时就没有考虑到“海”这种东西的存在，导致了恶魔果实能力者怕海。
总而言之，上面两种猜测各有各的优点和不足，但无论最终哪一种成为尾田确认的事实，都是可以在理论上说得通的。
