1、性质不同：拉尼娜现象就是太平洋中东部海水异常变冷的情况。厄尔尼诺是暖流，是太平洋一种反常的自然现象。
2、形成原因不同：拉尼娜东南信风将表面被太阳晒热的海水吹向太平洋西部，致使西部比东部海平面增高近60厘米，西部海水温度增高，气压下降，潮湿空气积累形成台风和热带风暴，东部底层海水上翻，致使东太平洋海水变冷。
3、对气候的影响不同：拉尼娜对气候的影响，北方强寒潮大风频繁出现，而降雨量却持续偏少，气温也居高不下。
厄尔尼诺对气候的影响，以环赤道太平洋地区最为显著。
4、出现时间不同：厄尔尼诺是一种周期性的自然现象，大约每隔7年出现一次。
出现厄尔尼诺现象的第二年，通常会出现拉尼娜现象，有时拉尼娜现象会持续两三年。
