超然楼，不仅布局美观、气势宏伟，而且具有悠久的历史。其原为元代著名大学士李泂湖上别业的主要建筑，约建于元武宗、仁宗时期（1307—1320），不晚于元至治元年（1321）。
李泂的湖上别业包括居室与亭园，居室即超然楼，楼名效仿苏轼所建、苏辙命名的超然台，取离尘脱俗，不受拘束之意。楼北辟为亭园，水岸建有举办宴集活动的天心水面亭，亭名取自北宋理学家邵雍诗句“月到天心处，风来水面时”，表现了“静中体道”的理学追求。
李泂在世时，湖上别业内的建筑屡有增建，据虞集《题李溉之学士湖上诸亭》诗可知，超然楼周边的景观有烟萝境、金潭云日、漏舟、紫霞沧洲、秋水观、无倪舟、红云岛、萧闲堂、松关、大千豪发、观心等。
元末时，李泂湖上别业的建筑遭到破坏，天心水面亭被毁。明代初年，超然楼及天心水面亭又得以修复。明人刘敕在《历乘》中记述该亭：“楼台轩敞，绚然于湖水之湄，榜曰‘湖山嘉境’。倚栏南望，乱峰入云，青林翠竹，五色交辉；北则垂杨袅袅，鹊华出树杪丈许，光景恍惚，隐隐如画图中。”因乘船可“荡漾于万荷之中，骚首弄波，寒香沁肺；沉鳞竞跃，目饫心怡”，故而被明代人列为“历下十六景”之一，称为“荷香北渚”。又据清康熙《山东通志》记载，明代靖难之役期间，铁铉曾在此犒劳守城将领。
明崇祯十二年（1639），超然楼毁于战火。据《明史》记载，崇祯十二年初，清军攻克济南城，屠城，屠杀百姓十万众，城内建筑多被焚毁。在这次清军入侵中，超然楼毁于战火，超然楼后的天心水面亭因位于水中而免于兵祸。
至此，超然楼在原址共存在310余年。
清军撤出济南后，地方官及士绅在城市遭受重大创伤、百废待兴的情况下，仍谋划着重修超然楼，其在济南的历史文化地位可见一斑。后因时代更迭，战乱多发，重建超然楼的工作未能完成，湖上别业仅存的天心水面亭也因水所坏。
清代初年，济南的士绅在天心水面亭以南的水岸上，即原超然楼旧址附近另建一亭，亦名“水面亭”，亭后有楼，仍称“超然楼”，但其规模则远逊于元、明时期的超然楼。复建的超然楼逐渐成为客舍，租赁客房给来济南的学生、举子们居住。新建的水面亭就逐渐成为超然楼的孑遗，成为追思先贤、名士聚会的所在。
清乾隆、嘉庆年间的诗人廖炳奎在其《水面亭怀元学士李溉之》一诗中写道：“故亭渺何处，怀古发高歌”，可见至迟在嘉庆年间，重建的超然楼以及天心水面亭一并破败了。百年来，无数文人墨客追寻旧迹，怀古抒怀，咏于诗文。
沧海横流，时代变迁，历经清代、民国逾210年，直至2008年，代表名士园林的超然楼得以重建。此次重建的超然楼屹立在大明湖畔，为一大型楼阁式建筑，铜瓦、铜栏、铜门、铜柱，典雅大气，气势宏阔，主体建筑面积5673平方米，与拱卫左右的裙楼博艺堂、贺胜斋，共同构成一组总建筑面积7473平方米的宋元风格建筑群，布局美观，巍峨挺拔，气势雄浑，蔚为大观。
