两个词的区别在于侧重点上有所不同。心意的意思是心里,意思。多侧重于表达对人的情意。如略表心意等。
心仪的意思内心仰慕,向往。多侧重于表达对某物或某人有好感。比如说,今天是一个值得庆贺的日子,小李经过不懈努力,终于考上了心仪的大学。