神探狄仁杰里薛青麟一案的最后真相如下:
真正的薛青麟死里逃生化名林永忠,做了县令,然后杀死了当初杀害他全家的假薛青麟等人,最后被狄仁杰保举升官。但是也是付出了巨大的代价,牺牲了女儿的一生。最终也没有与自己的女儿(锦娘)相认,孤独一人去赴任。