1、红树林生态系统。红树林是热带、亚热带、海岸带、海陆交错区生产能力最高的海洋生态系统之一，在净化海水、防风消浪、维持生物多样性、固碳储碳等方面发挥着极为重要的作用。
2、盐沼生态系统。盐沼是受周期性潮汐运动影响，覆盖有草本植物的滨海或岛屿边缘区域的滩涂。
3、海草床生态系统。海草床是中、低纬度海域潮间带中、下区和低潮线以下数米乃至数十米浅水区海生显花植物（海草）和草栖动物繁茂的平坦软相地带。
4、海藻场生态系统。沿岸潮间带下区和潮下带水深30米以内，浅硬质底区的大型底栖藻类与其他海洋生物群落共同构成的一种典型近岸海洋生态系统，广泛分布于冷温带以及部分热带和亚热带海岸。
5、珊瑚礁生态系统。由活珊瑚、死亡珊瑚的骨骼及其它礁区生物共同堆积组成的聚集体。
