地址不同，广州北站位于广州市花都区站前路1号，广州南站位于广州市番禺区石壁街道石壁村。车站等级不同，广州北站是三等站，广州南站是特等站。车站性质不同，广州南站是华南地区最繁忙的高铁站，是粤港澳大湾区、泛珠江三角洲地区的铁路核心车。
广州北和广州南的区别

广州北站的主要线路是京广铁路、京广高速铁路。广州南站的主要线路是京广高铁、广深港高速铁路、贵广高铁、南广铁路、广珠城轨、广佛环线、广惠城际铁路、广佛肇城际铁路。
截至2020年4月，广州北站的站台规模为8台16线(含广清城轨)。截至2019年，广州南站的站台规模为15台28线。
