剧场版一共三部，观影顺序分别是《来自深渊 启程的夜明》、《来自深渊 放浪的黄昏》、《来自深渊 深沉灵魂的黎明》。
该片于2017年7月7日起每周五20:30在AT-X首播。全13话。
总集篇电影《来自深渊 启程的黎明》、《来自深渊 放浪的黄昏》分别于2019年1月4日和18日在日本上映，中国台湾由普威尔代理发行，于同年2月22日和3月8日上映。
续篇电影《来自深渊 深沉灵魂的黎明》则于2020年1月17日在日本上映。
故事背景：“阿比斯”处处不可思议的景象，让人们为之着迷，并前仆后继地前去冒险。于是，数度挑战这巨洞的冒险家们，后来便被称为“探窟家”。
住在建造于阿比斯边缘的城镇“奥斯”的孤儿莉可，梦想着有一天要成为像母亲那样的伟大探窟家，力图解开阿比斯的谜团。
有一天，莉可母亲的白笛被人发现，让她毅然决定要潜入阿比斯深处。而莉可收留的失忆机器人·雷古为了找回自己的记忆，也决心和她同行。莉可在深界四层遭受穿弹兽的毒素折磨，而救了她的人就是“生骸”娜娜奇。
娜娜奇加入后，他们继续往波多尔多所在的深界五层冒险。在那里，遇到一个自称是普鲁修卡的女孩。
