1、地图区别 星际争霸2地图一开始是被探索过的(但是因为战争迷雾是暗的)，而不是像星际1那样全黑的。 战斗中的高地优势不存在了。然而，在一场战斗中地形仍很重要。比如，高地上进行攻击的单位不会显示给被攻击的单位。 星际争霸2在斜坡下面的单位无法选中斜坡顶上的敌人，但是会看到攻击单位短暂的影像。到达斜坡中间的单位将拥有斜坡上不受限制的视野。
2、伤害系统区别 星际争霸2现在单位将造成基础伤害加上对特定类型单位的额外伤害。某些异虫单位不仅能掘地还能在地下移动,使它们能从敌人下面穿过并轻松进入敌人的基地。 当一名玩家的主要建筑被摧毁了，他们将最终被显示。星际争霸1则不会。
3、阵营多变化 暴雪将星际争霸2升级的单位做各种视觉效果上的升级。反观星际争霸1不会有这种操作，星际争霸2人类的建筑和单位上可以添上自定义的花样，表示不同阵营的标志。星际1没有。星际争霸2比赛开始前玩家可以选择颜色。星际争霸1不会。
4、操作的不同 星际争霸2中的幽灵选定了一个核弹攻击范围，一个巨大的核弹符号出现在玩家面前。星际争霸1没有。星际争霸2玩家能选中255个单位。一个数字编队最多可以有200个单位，星际争霸1只能扩展12个单位。
5、PVP和PVE方面 星际争霸2可以多人游戏将包括即时菜单、计分板和数据显示。星际争霸1只会计分板和数据显示星际争霸2有7种ob模式：无菜单，资源，花费，单位，生产，部队和apm。星际争霸1只有资源显示
