几乎每个人的便便都是臭的，但如果排便太臭，臭不可闻，臭味弥漫，就不正常了。造成这种情况的原因比较多，但最终导致粪便发臭的物质却并不复杂，无非是胺类、吲哚、硫化氢和臭粪素等。它们主要来自肠道菌群分解未消化吸收的食物成分，尤其是蛋白质或其他含硫物质等。凡是让大肠中蛋白质或其他含硫物质明显增加的因素，都可以导致粪便太臭。
1.饮食摄入高蛋白
我们每天摄入的鱼、肉、蛋、奶、大豆等高蛋白食物，其中所含蛋白质总有一少部分无法被小肠消化吸收，于是进入大肠，并在大肠中被细菌分解利用（生理学称之为“腐败作用”），并产生胺类、吲哚、硫化氢等臭味成分。如果你摄入高蛋白饮食，将会有大量未吸收的蛋白质进入大肠，腐败作用“旺盛”，臭味开花。
要强调的是，来源于肉类、蛋类等食物的蛋白质含有更多的硫元素（含硫氨基酸），其含量远远超过大豆制品，而硫元素在大肠细菌腐败作用中会生成硫化氢，硫化氢其臭无比，所以如果摄入较多肉类或蛋类的话，便便更臭。
值得注意的是，大蒜、洋葱、萝卜等蔬菜虽然不是高蛋白食物，但也含有较多硫元素（硫化物），在大肠菌群作用下也会转化成硫化氢，让粪便臭上加臭。因此，素食有时并不能避免粪便过臭。
2.消化吸收不好
老年人、消化不良、胃酸缺乏等情况下，消化吸收能力减退，正常饮食摄入的蛋白质也有很多未能吸收，进入大肠在细菌腐败作用下让粪便更臭。
乳糖不耐受是另外一个常见原因，一部分人小肠缺乏乳糖酶，摄入奶类后无法消化其中的乳糖。一方面，乳糖进入大肠后被细菌发酵，产生气体（屁很多）和臭味（不是恶臭）；另一方面，也缩短奶类蛋白质在小肠内停留时间，使一些蛋白质及其消化产物来不及完全吸收，进入大肠在细菌腐败作用下让粪便更臭。
3.肠道疾病
细菌性肠炎（多伴有明显腹泻）时粪便往往有腥臭味；肠道克罗恩病（一种原因不明的肠道炎症性疾病）、溃疡性结肠炎等疾病也会让便便更臭，这一方面与食物无法正常消化吸收有关，另一方面也与肠道菌群失调有关。
因为粪便中的臭味物质大多数是在肠道菌群作用下产生的，所以肠道菌群的种类如何，是腐败作用（很臭或恶臭）强，还是发酵作用（不臭或酸臭）强，都与便便的气味直接相关。
不论如何，从肠道菌群平衡的角度，便便还是不要太臭才好。
