1 建筑设计不同 2 所在位置不同 3 运行路线不同
上海站是市区的老站，是普铁、高铁列车都接发的综合车站。上海虹桥站是在闵行区新建的新铁路车站，以接发高铁列车为主。
1、两者的建筑设计不同。
上海虹桥站主体建筑由站房、无站台柱雨棚、站场设备、南北辅助办公楼等部分组成，站房采用线上高架候车、线下出站的结构，在东西两侧均设置高架落客平台，外观与机场候机楼相似。
上海站的站厅采用由华东建筑设计院提出的“南北开口、高进低出、跨线候车”的方案。上海站在主站厅外东南侧，即秣陵路梅园路路口处兴建了联合售票大厅，整座大厅共设有40余个窗口。
2、两者的地理位置不同。
上海虹桥站位于上海市闵行区申贵路1500号，而上海站位于上海市静安区秣陵路303号。
3、两者的主要线路不同。
上海虹桥站的主要线路为：京沪高速铁路、沪汉蓉高速铁路、沪杭甬客运专线、沪昆高速铁路。而上海站的主要线路是：京沪铁路、沪昆铁路、沪宁城际铁路。
