您可以通过以下步骤在支付宝中注销车管所档案：
1. 登录支付宝。
2. 点击“我的”选项卡。
3. 在“服务”中点击“城市服务”。
4. 在“城市服务”中找到“车管所业务办理”，进入后点击“在线办理”。
5. 进入“车管所业务办理”页面后，选择“个人档案变更”。
6. 进入“个人档案变更”页面后，输入您的车管所账号和密码，然后点击“登录”。
7. 在“个人档案变更”页面中，找到“注销档案”选项，并点击“注销”。
8. 输入您的支付宝密码，然后点击“确认”。
请注意，在办理注销车管所档案前，您需要确保您已经还清了所有相关费用，否则可能会影响到您的蚂蚁信用。
