在校车收费方面，由于我市绝大部分校车都由个人自行购置，乘车费用和缴费标准也不相同，现行收费方式是由家长和车主自行协商。根据《山东省服务价格管理目录》有关规定，校车收费不在管理目录中，并且我市校车购买渠道不同、车型不一样，如果统一收费标准将会产生许多不定因素。2013年各县区校车收费均价为，东营区和市直学校为1000-1800元/学年、广饶县1200-2000元/学年、利津县700-1600元/学年。垦利县、河口区每生按乘车距离缴纳600-720元不等，不足部分由县、区政府承担，农村低保子女免费乘车。
在财政补贴方面，市财政局安排550万余元用于建设动态校车管理平台。部分县区财政局每年列支专款对校车进行补贴。并且，部分县区正在论证提高校车补贴标准，有的县区正在筹划逐步实现学生免费乘车。
